对虾病毒疾病IMNV，新出变异株它会不会对虾行业产生新影响。

前言：

由沾染性肌坏死病毒 (IMNV) ，引起的沾染性肌坏死 (IMN) 病是对虾的很多病毒性疾病之一，已活着界规模内流传，并造成重年夜经济损失。该病最初于2002年在巴西东北部发现，随后于2006年左右从印度尼西亚的爪哇岛申报。

一、IMNV将呈现新的变异株

比来，印度西孟加拉邦报道了沾染性肌坏死病，已发现四种虾对IMNV易感，包含南美白对虾 ( Penaeus vannamei )、蓝对虾 ( P. stylirostris )、斑节对虾 ( P. monodon ) 和圣保罗对虾 ( Farfantepenaeus subtilis )。

由IMNV引起的疾病进展迟缓，在整个养殖周期中殒命率连续较低，终极累积殒命率为40%-60%。因为其对养殖虾业的重年夜负面影响，及其经济影响，IMNV已被天下动物卫生组织列为重点虾病。

IMNV对巴西的经济影响很年夜，据估量2002年至2005年间导致的损失高达4.4亿美元。然则，今朝必要紧迫更新环球规模内比来的临盆损失数据，以充足懂得和更普遍的相识IMNV对虾养殖的影响，自2016年以来，巴西的帕拉州、马拉尼昂州、皮奥伊州、塞阿拉州、娼寮奥格兰德州、阿拉戈斯州、塞尔希培州和巴伊亚州都记载到非常殒命率，这些殒命率进展得更快，累积殒命率高达80%。经由过程分子和组织病理学技术进行的疾病诊断证明了，受熏染动物中存在具有高病毒滴度的IMNV。我们猜测这些样本中呈现了一种新的IMNV毒株，与曩昔相比，它可能更具致病性，导致更高的殒命率。

本日，小编跟年夜家分享一项新的研讨：新型沾染性肌坏死病毒 (IMNV) 变异株与巴西南美白对虾比来爆发的疾病有关，该研讨肯定的新型IMNV毒株的全长基因组序列，并申报了它与来自巴西和印度尼西亚的其他IMNV毒株的遗传关系。

二、研讨设置

1、在这项研讨中，我们使用下一代测序来肯定来自塞阿拉州的新型IMNV菌株（Br-1）的完备基因组，该菌株来自2018年养殖周期，与非常高的殒命率有关。

2、本研讨中检测的熏染IMNV的南美白对虾，是2016年至2019年从贸易虾类养殖水池网络的，累计殒命率高达8%。这些水池位于巴西东北部地域，年夜部门养虾都在那边进行。

3、来自受影响的虾均匀重量为3.0克，这些虾采纳分子生物学和组织病理学阐发。

三、成果与讨论

1、关于对南美白对虾沾染性肌坏死 (IMN) 病和白斑病样本的筛查，从2016年到2019年，很多巴西南美白对虾养殖区都申报了该疾病的暴发。近年来，因为白斑病的爆发，该国的养虾业遭遇了重年夜损失。是以，我们最初推想疾病暴发，是由白斑综合症病毒 (WSSV) 引起的白斑病 (WSD)，只管病笃虾的临床症状彷佛与IMN更类似（图1A）。病笃的虾在腹节、尾足和尾扇变红（图1B）中显示出肌肉坏死的迹象。这些临床症状是IMN的特性。此外，在虾中还检测到淋巴器官球状体，显示出IMNV熏染的组织学特性（图1C）。

图 1：南美白对虾表示出典型的急性IMN体征，包含：局灶性至普遍性坏死，腹段肌肉发白；(B) 腹部坏死和尾扇变红，IMNV熏染的南美白对虾淋巴器官 (C) 腹横纹肌 (D) 组织切片的显微镜照片。

2、RT-PCR成果显示样本熏染了分歧水平的IMNV（拷贝数从26到3.6×10个11次方不等），而且未检测到WSSV或检测到的程度远低于IMNV。在初步检测到IMNV和WSSV之后，来自塞阿拉州、马拉尼昂州和皮奥伊州的一部门样本被送到亚利桑那年夜学的水产养殖病理学试验室。依照OIE保举的计划，使用及时RT-PCR再次测试这些样本的 IMNV。所有样品的IMNV检测均呈阳性，只有一个样品的IMNV呈阴性，来自塞阿拉州。

3、使用下一代测序对IMNV检测呈阳性的样簿子集进行了测序。从我们对全基因组测序的阐发来看，新IMNV基因组与参考基因组之间的统一性（百分比）为97.94%，注解这是一种新的IMNV毒株。这种新的IMNV菌株被定名为 Br-1，其全基因组体系发育注解它与来自印度尼西亚的IMNV菌株凑集在一路。Br-1全长基因组序列保藏于GenBank中，该数据库是由国度生物技术信息中心 (NCBI) 制造和维护，该中心隶属于美国国立卫生研讨院 (NIH)，是国际核苷酸序列数据库协作组织 (INSDC) 的一部门。

4、甲壳类动物疾病经由过程亲虾和虾苗的移动，而增长越境流传的风险，导致很多病原体作为环球存眷的疾病被纳入WOAH的国际立法框架。是以，甲壳类动物在越境转移之前必要接受这些疾病的筛查。这是削减这些病原体对环球水产养殖和渔业临盆影响的紧张对象。

5、自20世纪80年月中期以来，周期性呈现影响环球养殖虾业的病毒病原体——例如：对虾杆状病毒(BP)、沾染性皮下和造血坏死病毒 (IHHNV)、陶拉综合症病毒 (TSV)、黄头病毒 (YHV) 、白斑综合症病毒 (WSSV) 和比来的IMNV，在环球规模内严重影响了养虾行业。这些病毒性疾病的流行，归因于患病亲虾、虾苗和商品虾的越境移动。

在IMNV呈现之前，很多病毒性虾病原体活着界规模内流传，IMNV于2002年在巴西呈现，并随后于2006年流传到印度尼西亚，这体现了人们未在亲虾生意业务的中“汲取的教训”。

四、研讨概念

在鱼类和甲壳类水产养殖中，在分歧区域之间迁徙和运输是一种常见做法。这种做法存在风险，由于共生体、寄生虫和疾病可能会疏散到奇特的地舆前提下，并使得底本无病的鱼虾熏染新的疾病。

依据我们的研讨成果，基因组体系申报了一种来自巴西的新型IMNV基因型，它与来自印度尼西亚的IMNV毒株关系更亲密。是以，猜测推想，从印度尼西亚向巴西从新引入一种IMNV毒株可能会导致更强毒株的呈现。然而，必要对源自这两个国度的如今IMNV分别株进行年夜范围测序，以描写和确认这些奇特菌株的起源。然而，这些发现强调了对亲虾和虾苗进行疾病筛查，以防止潜在致命虾类疾病活着界规模内流传的紧张性。